2015-012518

特願２０１１－５２７８２３「修飾を有するｄｓＲＮＡによる遺伝子発現の特異的な阻害のための組成物および方法」拒絶査定不服審判事件〔平成２２年３月２５日国際公開、ＷＯ２０１０／０３３２２５、平成２４年２月２３日国内公表、特表２０１２－５０４３８９〕について、次のとおり審決する。

【結　論】 本件審判の請求は、成り立たない。

【理　由】 第１　手続の経緯 本願は、平成２１年９月１７日（パリ条約による優先権主張　２００８年９月２２日　（ＵＳ）アメリカ合衆国　２件）を国際出願日とする出願であって、平成２７年２月１９日付けで拒絶査定がされ、同年７月２日に拒絶査定不服審判の請求がされると同時に手続補正書が提出され、平成２９年１月２５日付けで拒絶の理由が通知され、同年５月１８日に意見書及び手続補正書が提出されたものである。 第２　本願発明 本願発明は、平成２９年５月１８日提出の手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１ないし２１に記載された事項により特定されるものであり、その請求項１に係る発明は、以下のとおりのものである。 「【請求項１】 ｉ）第１の鎖、および、 ｉｉ）第２の鎖、を含む単離された二重鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）であって、 前記第１の鎖は、長さが２５～６７ヌクレオチドであり； 前記第２の鎖は、長さが１９～２７ヌクレオチドであり； 前記第１および第２の鎖は、長さが１９～２３塩基対である二重鎖を形成し； 前記第１の鎖は、前記二重鎖に隣接する、１～２０塩基対の第二の二重鎖を形成し； 前記第１の鎖は、前記第二の二重鎖に隣接するテトラループを含み； 前記第２の鎖は、前記第１の鎖の5'末端とブラントエンドを形成するか、または１、２、３もしくは４ヌクレオチドからなる3'オーバーハングを含み； 前記ｄｓＲＮＡは、第１の鎖の末端と第２の鎖の末端との間に不連続を含み；および 前記ｄｓＲＮＡは、哺乳動物細胞において標的遺伝子発現を減少させる、単離された二重鎖ＲＮＡ。」（以下、この発明を「本願発明１」という。） 第３　引用例の記載 平成２９年１月２５日付けの当審による拒絶理由通知において引用した本願の優先日前に頒布された、「二本鎖オリゴヌクレオチド」という名称の発明を記述する特表２００５－５１５７８０号公報（以下、「引用例６」という。）には以下の事項が記載されている。（下線は当審で付与した。） １　特許請求の範囲 (１)　「【請求項１】　以下の構造： 【化１】 ［式中， （１）Ｎは長さが等しい相補的オリゴヌクレオチド鎖中のヌクレオモノマーであり，Ｎの配列は標的遺伝子配列に対応しており，そして （２）ＸおよびＹはそれぞれ独立して以下から成る群から選択される：存在しない；約１から約２０ヌクレオチドの5'オーバーハング；約１から約２０ヌクレオチドの3'オーバーハング；および約４から約２０ヌクレオモノマーから成るループ構造（ここでヌクレオモノマーはＧおよびＡから成る群から選択される）］を有する二本鎖オリゴヌクレオチド組成物。」 (２)　「【請求項２】　以下の構造： 【化２】 ［式中， （１）oligoAはある数のヌクレオモノマーのオリゴヌクレオチドであり； （２）oligoBはoligoAと同数のヌクレオモノマーを有し，oligoAに相補的であるオリゴヌクレオチドであり； （３）oligoAまたはoligoBのいずれかは標的遺伝子配列に対応しており； （４）Ｘは以下から成る群から選択され：（ａ）存在しない；（ｂ）oligoAの5'末端に共有結合して5'オーバーハングを構成する約１から約２０ヌクレオチドのオリゴヌクレオチド；（ｃ）oligoBの3'末端に共有結合して3'オーバーハングを構成する約１から約２０ヌクレオチドのオリゴヌクレオチド；および（ｄ）oligoBの3'末端とoligoAの5'末端に共有結合してループ構造を構成する約４から約２０ヌクレオモノマーのオリゴヌクレオチド（ここでヌクレオモノマーはＧおよびＡから成る群から選択される）；そして （５）Ｙは以下から成る群から選択される：（ａ）存在しない；（ｂ）oligoBの5'末端に共有結合して5'オーバーハングを構成する約１から約２０ヌクレオチドのオリゴヌクレオチド；（ｃ）oligoAの3'末端に共有結合して3'オーバーハングを構成する約１から約２０ヌクレオチドのオリゴヌクレオチド；および（ｄ）oligoAの3'末端とoligoBの5'末端に共有結合してループ構造を構成する約４から約２０ヌクレオモノマーのオリゴヌクレオチド（ここでヌクレオモノマーはＧおよびＡから成る群から選択される）］を有する二本鎖オリゴヌクレオチド組成物。」 (３)　「【請求項８】　ＸまたはＹがループを形成する約４から約２０ヌクレオモノマーの配列であり，ヌクレオモノマーがＧおよびＡから成る群から選択される，請求項２記載の組成物。」 (４)　「【請求項９】　２つの隣接するＮが結合していない，請求項８記載の組成物。」 ２　発明の概要 (１)　「本発明は，少なくとも一部は，アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび保護オリゴヌクレオチドを含む二本鎖オリゴヌクレオチドが遺伝子機能を阻害する能力を有するという発見に基づいている。」（段落【０００４】） (２)　「ある観点では，本発明は以下の構造を有する二本鎖オリゴヌクレオチド組成物に関する： 【化７】 ［式中，（１）Ｎは長さが等しい相補的オリゴヌクレオチド鎖中のヌクレオモノマーであり，Ｎの配列は標的遺伝子配列に対応しており，（２）ＸおよびＹは以下の群からそれぞれ独立して選択される：存在しない；約１から約２０ヌクレオチドの5'オーバーハング；約１から約２０ヌクレオチドの3'オーバーハング；および約４から約２０ヌクレオモノマーから成るループ構造（ここでヌクレオモノマーはＧおよびＡから成る群から選択される）］。 “オーバーハング”は二本鎖オリゴヌクレオチド分子の5'-または3'-ヒドロキシル末端上の相対的に短い１本鎖ヌクレオチド配列である（“伸長鎖”，“突出末端”，または“接着末端”とも呼ばれる）。 ・・・ １つの態様においては，Ｎのうち２つは未結合である，すなわち２つのヌクレオモノマー間にはホスホジエステル結合が存在しない。」（段落【０００６】～【００１０】） ３　発明の詳細な説明 (１)　二本鎖オリゴヌクレオチド組成物 ア　「本発明の二本鎖オリゴヌクレオチド組成物は標的遺伝子にコードされる標的蛋白質の合成を阻害する能力を有する。」（段落【００２６】） イ　「“オリゴヌクレオチド”という用語は，結合（例えばホスホジエステル）または置換結合によって互いに共有結合した２つ以上のヌクレオモノマーを含む。・・・例えば１つの態様においては，オリゴヌクレオチドはセンスまたはアンチセンス配列中にニックを含んでもよい。」（段落【００２８】） ウ　「ニックはオリゴヌクレオチド中の２つの非結合ヌクレオモノマーである。ニックはセンスまたはアンチセンスヌクレオチド配列沿いのいずれかの位置に含まれる。好ましい態様では，ニックはセンス配列中に存在する。別の好ましい態様では，ニックはオリゴヌクレオチドのデュープレックス領域の末端から少なくとも約４ヌクレオモノマーである（例えばオリゴヌクレオチドの5'もしくは3'末端から，またはループ構造から少なくとも約４ヌクレオモノマー離れて存在する）。」（段落【００３３】） エ　「１つの態様においては，本発明の二本鎖デュープレックスコンストラクトをヌクレアーゼに対して更に安定化するために，コンストラクトのセンスまたはアンチセンス鎖の5'または3'末端にループ構造を形成させることができる。例えばコンストラクトは以下のような形態であってもよい： 【化１３】 ［式中，Ｎは長さが等しい（例えば約１２から約４０ヌクレオチド長の）相補的オリゴヌクレオチド鎖中のヌクレオモノマーであり（すなわち上段のＮ鎖は下段のＮ鎖と相補的である），ＸおよびＹはそれぞれ独立して以下から成る群から選択される：存在しない（すなわちコンストラクトはループおよびオーバーハングを有さない平滑末端コンストラクトである）；約１から約２０ヌクレオチドの5'オーバーハング；約１から約２０ヌクレオチドの3'オーバーハング；ＧＡＡＡループ（テトラループ）；および約４から約２０ヌクレオモノマーから成るループ（ここでヌクレオモノマーは全てＧまたはＡである）］。 Ｎの配列は標的遺伝子配列に対応する（例えば標的遺伝子配列に対してセンスまたはアンチセンスであるヌクレオチド配列と相同または同一である）が，ループ構造のヌクレオチド配列は標的遺伝子配列に対応しない。 例えば，それらのループはＧおよびＡのみを含有し，約４から約２０ヌクレオチド長であってもよい。１つの態様においては，それらのループは配列ＧＡＡＡを有するテトラループであってもよい。 【化１４】 １つの態様においては，Ｎの数は約２７である。 コンストラクトの一端または両端がループで１つの態様においては，オリゴヌクレオチドに“ニック”（センスまたはアンチセンス鎖のいずれか（しかし好ましくはセンス鎖）の位置にある２つの結合していないヌクレオモノマー）を含有させて分割することができる。好ましくは，ニックはデュープレックス領域の最も近い末端から少なくとも４塩基離れている（十分な熱力学的安定性を得るために）。」（段落【００９４】～【００９８】） (２)　疾病または疾患の治療 「本発明のオリゴヌクレオチド組成物は，遺伝子の発現を阻害することにより，蛋白質の発現が関与する任意の疾病を治療するために用いることができる。」（段落【０２３５】） 第４　当審の判断 １　引用例６に記載された発明 前記第３より、引用例６には、以下の構造：【化１】 を有する二本鎖オリゴヌクレオチドであって、遺伝子の発現を阻害する能力を有する二本鎖オリゴヌクレオチド組成物が記載されているところ、特に前記第３の３(１)ウ及びエより、上記【化１】で示される構造式において、Ｘが存在せず、Ｙが配列ＧＡＡＡを有するテトラループで、Ｎが２７の標的遺伝子配列に対応する配列を有し、かつ、3'-oligo(N)-5'（センス鎖）の3'末端から少なくとも４ヌクレオモノマー、及び、3'-oligo(N)-5'（センス鎖）の5'末端、すなわち、ループ構造から少なくとも４ヌクレオモノマー離れて存在するニックを有する二本鎖オリゴヌクレオチド組成物が記載されているものと認められる。（以下、この構造を有する二本鎖オリゴヌクレオチドのことを、「引用発明」という。） ２　本願発明１と引用発明の対比・判断 本願発明１と引用発明を対比する。 両者は、第１の鎖及び第２の鎖を含み、第１の鎖の末端と第２の鎖の末端との間に不連続を含み、かつ、標的遺伝子発現を減少させる単離された二重鎖ＲＮＡである点において共通し、本願発明１において、第１の鎖の長さが３５～３９ヌクレオチドであり、第２の鎖の長さが１９～２３ヌクレオチドであり、第１及び第２の鎖が長さ１９～２３塩基対である二重鎖を形成し、第１の鎖は前記二重鎖に隣接する４～８塩基対の第二の二重鎖を形成し、第１の鎖は前記第二の二重鎖に隣接する配列ＧＡＡＡを有するテトラループを含み、第２の鎖は第１の鎖の5'末端とブラントエンドを形成する場合は、引用発明におけるニックが、3'-oligo(N)-5'の5'末端、すなわち、テトラループから４～８ヌクレオモノマー離れて存在する場合に相当する。 このように、本願発明１と引用発明に相違点はなく、両者は、同一の発明である。 ３　審判請求人の主張について 請求人は、引用例６の前記第３の３(１)イないしエの記載を根拠に、引用例６は、その全体にわたって、分子の鎖の中にニックがある態様、すなわち、標的遺伝子配列に対応する鎖が不連続を含む態様を開示しているのに対し、本願発明は、第１の鎖の末端と第２の鎖の末端との間に不連続を含む点において相違する旨を主張する。 しかし、本願の発明の詳細な説明には、「本明細書に使用される、『ガイド鎖』は、標的ＲＮＡのものに対して相補的な配列を有し、かつ標的ＲＮＡに対する結合によってＲＮＡ干渉を生じるｄｓＲＮＡの一本鎖核酸分子をいう。ＤｉｃｅｒによるｄｓＲＮＡの切断の後、ガイド鎖の断片は、ＲＩＳＣと会合したままで、ＲＩＳＣ複合体の成分として標的ＲＮＡに結合して、ＲＩＳＣによる標的ＲＮＡの切断を促進する。本明細書に使用される、ガイド鎖は、必ずしも連続した一本鎖核酸をいうわけではなく、好ましくはＤｉｃｅｒによって切断される部位にて不連続を含んでいてもよい。ガイド鎖は、アンチセンス鎖である。」（段落【００３９】）と記載されているところ、本願の特許請求の範囲には、第１の鎖と第２の鎖で形成される長さが１９～２３塩基対である二重鎖の部分のみが、標的遺伝子配列（標的ＲＮＡ）に対応する配列である旨の特定はなく、不連続を挟んで上記二重鎖に隣接する長さが１～２０塩基対の第二の二重鎖の部分も、標的遺伝子配列に対応する配列であることを本願発明１は許容するものである。 このように、本願発明１も標的遺伝子配列に対応する分子の鎖の中に不連続（ニック）がある態様も包含することから、請求人の上記主張は失当である。 第５　むすび 以上のとおり、本願発明１は、引用例６に記載された発明であることから、特許法第２９条第１項第３号の規定により特許を受けることができない。 したがって、他の請求項について検討するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。 よって、結論のとおり審決する。