2014-022300

特願２０１１－５５２４６７「分子のアレイから複製又は派生物を作製するための装置及び方法とその応用」拒絶査定不服審判事件〔平成２２年　９月１０日国際公開、ＷＯ２０１０／１００２６５、平成２４年　８月３０日国内公表、特表２０１２－５１９４７５〕について、次のとおり審決する。

【結　論】 本件審判の請求は、成り立たない。

【理　由】 第１　手続の経緯 本願は、平成２２（２０１０）年３月５日（パリ条約による優先権主張外国庁受理　２００９年３月６日　ドイツ（ＤＥ））を国際出願日とする出願であって、平成２６年６月２５日付けで拒絶査定がされたところ、同年１１月４日に拒絶査定不服審判の請求がされ、当審による平成２８年１月２７日付け拒絶理由（以下、単に「拒絶理由」という）に応答して、同年７月２８日に意見書および手続補正書が提出されたものである。 第２　本願発明 本願の請求項に係る発明（以下、「本願発明」という）は、平成２８年７月２８日付け手続補正書により補正された特許請求の範囲の請求項１～１５に記載された発明特定事項により特定されるものであるところ、その請求項１に係る発明（以下、「本願発明１」という）は、以下のとおりのものと認める。 「【請求項１】 ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、修飾ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、もしくはｓｉＲＮＡからなる群から選択される生体分子または合成的に生成された化学分子（１６；３２；５０）のアレイの複製又は派生物を作製する方法であって、 前記アレイは、分離した分子（１６；３２；５０）サンプルの空間配置を含み、 前記方法は、 サンプルごとに、他のサンプルの有効領域（２４；３５；５４）と分離している、少なくとも一つの空間的に制限された有効領域（２４；３５；５４’）をつくるステップであって、 前記有効領域（２４；３５；５４）は、他のサンプルの有効領域と分離する機能を有するものであり、前記有効領域（２４；３５；５４’）は、空間的に制限された増幅薬領域を含むものであり、結合アダプタ（２２；３８；６２）又は結合特性を供給されたキャリア（２０；３４；６０）の表面と接し、空間的に塞がれたキャビティ、電場又は磁場、疎水性／親水性の領域、流体および気体間の界面、および／または、粘性の異なるレベルの液体間の界面によって形成されるものである、前記ステップ、 前記有効領域（２４；３５；５４’）において、増幅薬によって、前記分子（１６；３２；５０）を増幅することによって、複製（１８；３２；６４）をつくるステップ、又は、前記有効領域（２４；３５；５４’）において、前記分子の派生物をつくるステップであって、前記派生物はＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＲＮＡ、もしくはタンパク質からなる群から選択されるものであり、かつ、ＲＮＡはＤＮＡから転写されるものであり、および／またはタンパク質はＲＮＡの生化学情報によって産生されるものであり、 前記キャリア上の前記サンプルの前記複製又は派生物の空間配置が、前記アレイの前記サンプルの前記空間配置に対応するように、前記結合アダプタ又は前記結合特性（２２；３８；６２）によって、前記キャリア（２０；３４；６０）と、前記サンプルの前記複製又は派生物（１８；３２；６４）を結合するステップであって、前記複製又は派生物を前記キャリアに結合する工程は、前記増幅または派生物の作製と同時に実行されること、および、 前記アレイから前記サンプルの前記複製又は派生物（１８；３２；６４）を含んでいる前記キャリア（２０；３４；６０）を取り除くステップ、 を含むこと、を特徴とする、方法。」 第３　引用例 １．引用例１ 拒絶理由において「引用例１」として引用した、本願優先日前に頒布された刊行物である特開２００１－１８３号公報（以下、「引用例１」という）には、以下の事項が記載されている。 なお、下線は強調のため当審で付与したものである。以下、同様である。 （１－ａ）「ＤＮＡチップを作製する装置において、 母体となる基板上にあらかじめ用意された複数のＤＮＡをＰＣＲ法により増幅する手段と、 この増幅されたＤＮＡを各セルの相互位置を保持したまま直接接触により他の基板へ転写する手段を備えたことを特徴とするＤＮＡチップ作製装置。」（請求項１） （１－ｂ）「前記ＰＣＲ法により増幅する手段は、前記母体となる基板の第1次コピーである転写基板上で、または前記母体となる基板と転写基板の結合状態においてＰＣＲを行うようにしたことを特徴とする請求項１記載のＤＮＡチップ作製装置。」（請求項２） （１－ｃ）「前記母体となる基板または母体となる基板よりＤＮＡが転写された他の基板は、各セルが多孔質基材で形成されたことを特徴とする請求項１記載のＤＮＡチップ作製装置。」（請求項３） （１－ｄ）「前記ＰＣＲの実行時にのみ各セル間にセル分離用の隔壁を設けておくことを特徴とする請求項１記載のＤＮＡチップ作製装置。」（請求項５） （１－ｅ）「また、請求項５のように、前記ＰＣＲの実行時にのみ各セル間にセル分離用の隔壁を設けておくこともできる。これにより隣接ＤＮＡの分離が完璧になる。」（【００１０】） （１－ｆ）「本発明では次のような原理に基づいてＤＮＡチップを量産する。図１の（ａ）に示すように母体となるＤＮＡチップ１上でＰＣＲによりＤＮＡを増幅し、各セルの相互位置を保持したまま同図（ｂ）に示すようにこれを別の基板２に直接接触させて転写する。 次に基板２をマザーとして同様にＤＮＡ増幅・転写を行う。これを繰り返し行い、同図（ｃ）のように、ねずみ算的に大量の複製を作製する。あるいは、１つのマザー基板（ＤＮＡチップ１）からＤＮＡ増幅・転写を行い、大量の複製を作製することもできる。なお、ＰＣＲは母体となる基板と転写基板を結合した状態で行うようにしてもよい。」（【００１２】～【００１３】） （１－ｇ）「マザー基板１上のセルは、転写される基板（コピー基板という）２と同じ大きさではなく大容量とし、図２に示すように、多孔質状のセル（たとえばスポンジ）３を複数個整列し、そこにＤＮＡを含ませる。コピー基板を押し付ける力を制御して一度の転写で写す量を制御できるようにする。なお、転写により減少したマザー基板側のＤＮＡはＰＣＲにより増幅して補うようにする。」（【００１４】） （１－ｈ）「コピー基板２への転写後は駆動機構部１４を作動させて保持部１３を上方に移動させ、コピー基板２をマザー基板１から離し、取り外す。」（【００２１】） （１－ｉ）「 」（図１） （１－ｊ）「 」（図２） （１－ｋ）「 」（図５） 引用例１記載事項（１－ａ），（１－ｆ）の下線部分及び（１－ｉ）の図１より、引用例１には、引用例１記載事項（１－ａ）の各手段を備えたＤＮＡチップを作製する装置の記載から、当該各手段に対応する各ステップを含むＤＮＡチップを作製する方法が実質的に記載されているものと認められる。 また、引用例１記載事項（１－ｃ），（１－ｇ）の下線部分及び（１－ｊ）の図２より、引用例１には、母体となる基板上にＤＮＡを含ませた多孔質状のセル（たとえばスポンジ）を配置することが記載されているといえる。 さらに、引用例１記載事項（１－ｄ），（１－ｅ）の下線部分及び（１－ｋ）の図５より、引用例１には、各セル間にセル分離用の隔壁を設けることが記載されているといえる。 そして、引用例１記載事項（１－ｈ）の下線部分より、コピーした基板を元のマザー基板から離し、取り外すことが記載されているといえる。 以上のことから、引用例１には次の発明（以下、「引用発明」という）が記載されているものと認められる。 「ＤＮＡチップを作製する方法であって、 母体となる基板上にＤＮＡを含ませた多孔質状のセル（たとえばスポンジ）を配置し、各セル間にセル分離用の隔壁を設け、当該基板上であらかじめ用意された複数のＤＮＡをＰＣＲ法により増幅するステップと、 この増幅されたＤＮＡを各セルの相互位置を保持したまま直接接触により他の基板へ転写するステップと、 コピーした基板を元のマザー基板から離し、取り外すステップ を備えたことを特徴とする方法。」 第４　対比 本願発明１は、各構成要素に関して複数の選択肢を有するところ、以下の下線部分 「ＤＮＡ、ｃＤＮＡ、修飾ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、もしくはｓｉＲＮＡからなる群から選択される生体分子または合成的に生成された化学分子（１６；３２；５０）のアレイの複製又は派生物を作製する方法であって、 前記アレイは、分離した分子（１６；３２；５０）サンプルの空間配置を含み、 前記方法は、 サンプルごとに、他のサンプルの有効領域（２４；３５；５４）と分離している、少なくとも一つの空間的に制限された有効領域（２４；３５；５４’）をつくるステップであって、 前記有効領域（２４；３５；５４）は、他のサンプルの有効領域と分離する機能を有するものであり、前記有効領域（２４；３５；５４’）は、空間的に制限された増幅薬領域を含むものであり、結合アダプタ（２２；３８；６２）又は結合特性を供給されたキャリア（２０；３４；６０）の表面と接し、空間的に塞がれたキャビティ、電場又は磁場、疎水性／親水性の領域、流体および気体間の界面、および／または、粘性の異なるレベルの液体間の界面によって形成されるものである、前記ステップ、 前記有効領域（２４；３５；５４’）において、増幅薬によって、前記分子（１６；３２；５０）を増幅することによって、複製（１８；３２；６４）をつくるステップ、又は、前記有効領域（２４；３５；５４’）において、前記分子の派生物をつくるステップであって、前記派生物はＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ＲＮＡ、もしくはタンパク質からなる群から選択されるものであり、かつ、ＲＮＡはＤＮＡから転写されるものであり、および／またはタンパク質はＲＮＡの生化学情報によって産生されるものであり、 前記キャリア上の前記サンプルの前記複製又は派生物の空間配置が、前記アレイの前記サンプルの前記空間配置に対応するように、前記結合アダプタ又は前記結合特性（２２；３８；６２）によって、前記キャリア（２０；３４；６０）と、前記サンプルの前記複製又は派生物（１８；３２；６４）を結合するステップであって、前記複製又は派生物を前記キャリアに結合する工程は、前記増幅または派生物の作製と同時に実行されること、および、 前記アレイから前記サンプルの前記複製又は派生物（１８；３２；６４）を含んでいる前記キャリア（２０；３４；６０）を取り除くステップ、 を含むこと、を特徴とする、方法。」 を選択した以下の発明を「本願発明１’」として、引用発明と対比する。 「ＤＮＡから選択される生体分子または合成的に生成された化学分子のアレイの複製を作製する方法であって、 前記アレイは、分離した分子サンプルの空間配置を含み、 前記方法は、 サンプルごとに、他のサンプルの有効領域と分離している、少なくとも一つの空間的に制限された有効領域をつくるステップであって、 前記有効領域は、他のサンプルの有効領域と分離する機能を有するものであり、前記有効領域は、空間的に制限された増幅薬領域を含むものであり、結合特性を供給されたキャリアの表面と接し、空間的に塞がれたキャビティによって形成されるものである、前記ステップ、 前記有効領域において、増幅薬によって、前記分子を増幅することによって、複製をつくるステップ、 前記キャリア上の前記サンプルの前記複製の空間配置が、前記アレイの前記サンプルの前記空間配置に対応するように、前記結合特性によって、前記キャリアと、前記サンプルの前記複製を結合するステップであって、前記複製を前記キャリアに結合する工程は、前記増幅の作製と同時に実行されること、および、 前記アレイから前記サンプルの前記複製を含んでいる前記キャリアを取り除くステップ、 を含むこと、を特徴とする、方法。」 引用発明の「ＤＮＡチップを作製する方法」は、本願発明１’の「ＤＮＡから選択される生体分子または合成的に生成された化学分子のアレイの複製を作製する方法」に相当し、引用発明の「母体となる基板上にＤＮＡを含ませた多孔質状のセル（たとえばスポンジ）を配置し、各セル間にセル分離用の隔壁が設け」は、本願発明１’の「前記アレイは、分離した分子サンプルの空間配置を含み」に相当する。 また、引用発明の「あらかじめ用意された複数のＤＮＡをＰＣＲ法により増幅するステップ」は、本願発明１’の「増幅薬によって、前記分子を増幅することによって、複製をつくるステップ」に相当する。 さらに、引用発明の「この増幅されたＤＮＡを各セルの相互位置を保持したまま直接接触により他の基板へ転写するステップ」は、本願発明１’の「前記キャリア上の前記サンプルの前記複製の空間配置が、前記アレイの前記サンプルの前記空間配置に対応するように、前記結合特性によって、前記キャリアと、前記サンプルの前記複製を結合するステップ」に相当する。 そして、引用発明の「コピーした基板を元のマザー基板から離し、取り外すステップ」は、本願発明１’の「前記アレイから前記サンプルの前記複製を含んでいる前記キャリアを取り除くステップ」に相当する。 そうすると、本願発明１’と引用発明の両者は、 「ＤＮＡから選択される生体分子または合成的に生成された化学分子のアレイの複製を作製する方法であって、 前記アレイは、分離した分子サンプルの空間配置を含み、 前記方法は、 増幅薬によって、前記分子を増幅することによって、複製をつくるステップ、 前記キャリア上の前記サンプルの前記複製の空間配置が、前記アレイの前記サンプルの前記空間配置に対応するように、前記結合特性によって、前記キャリアと、前記サンプルの前記複製を結合するステップ、および、 前記アレイから前記サンプルの前記複製を含んでいる前記キャリアを取り除くステップ、 を含むこと、を特徴とする、方法。」 である点で一致し、以下の２点で相違する。 相違点１：本願発明１’は、「前記複製を前記キャリアに結合する工程は、前記増幅の作製と同時に実行されること」が特定されているに対して、引用発明はかかる特定を有しない点。 相違点２：本願発明１’は、「サンプルごとに、他のサンプルの有効領域と分離している、少なくとも一つの空間的に制限された有効領域をつくるステップであって、 前記有効領域は、他のサンプルの有効領域と分離する機能を有するものであり、前記有効領域は、空間的に制限された増幅薬領域を含むものであり、結合特性を供給されたキャリアの表面と接し、空間的に塞がれたキャビティによって形成されるものである、前記ステップ」を含むのに対して、引用発明は有効領域をつくるステップについての特定を有しない点。 第５　当審の判断 上記相違点１，２について検討する。 相違点１について： 引用例１記載事項（１－ｂ）及び（１－ｆ）の下線部分にあるとおり、母体となる基板と転写基板の結合状態においてＰＣＲを行ってもよい旨記載されている以上、引用発明において、母体となる基板と転写基板が結合した状態で複数のＤＮＡをＰＣＲ法により増幅することは、当業者であれば容易になし得るものである。そして、母体となる基板と転写基板が結合した状態においてＰＣＲを行えば、ＤＮＡは増幅されると同時にその増幅産物が転写基板に転写（結合）されることは明らかである。 したがって、上記相違点１は当業者が容易になし得るものである。 相違点２について： 上記相違点１で示したとおり、母体となる基板と転写基板が結合した状態で複数のＤＮＡをＰＣＲ法により増幅すれば、ＤＮＡを含むサンプルごとに空間的に制限された（ＰＣＲの）有効領域ができることは自明のことであり、「前記有効領域は、他のサンプルの有効領域と分離する機能を有するものであり、前記有効領域は、空間的に制限された増幅薬領域を含むものであり、結合特性を供給されたキャリアの表面と接し、空間的に塞がれたキャビティによって形成される」ことは明らかである。 そして上述のとおり、上記相違点１について当業者であれば容易になし得るものであるのだから、それにより形成される有効領域に関する上記相違点２も、上記相違点１と同様に当業者が容易になし得るものである。 そして、本願発明１’の効果についても、ＤＮＡのアレイの複製を作製できるという当業者が予測できる程度の効果に過ぎない。 したがって、本願発明１’は引用例１に記載された発明から当業者が容易に発明をすることができたものである。 第６　審判請求人の主張 平成２８年７月２８日付け意見書において、審判請求人は主に以下の２点を主張している。 主張１：本願発明は、複製をキャリアに結合する工程は、増幅の作製と同時に実行されることを特徴として含むものです（本願明細書段落００８０、図６ａ～図６ｄ）。引用例１では、図４からみても増幅と転写を同時に行うことは予定されてないことが明らかです。 主張２：本願発明は増幅およびキャリアへの転写が同時に起こる特徴を有するために、空間的に塞がれたキャビティが形成されること（閉鎖系アレイ）を特徴とし、引用例１に記載の開放系のアレイのような問題は生じません。 上記主張１，２について検討する。 主張１について： 相違点１について判断したとおり、引用例１には、審判請求人の主張する図４の態様のみならず、引用例１記載事項（１－ｂ）及び（１－ｆ）には母体となる基板と転写基板の結合状態においてＰＣＲを行う態様も記載されており、このときにサンプルであるＤＮＡは増幅されると同時にその増幅産物が転写基板に転写（結合）されることは明らかである。 よって、引用例１では増幅と転写を同時に行うことが予定されていないとする上記主張１は採用できない。 主張２について： 本願発明１における有効領域は、「空間的に塞がれたキャビティ」によって形成されるのみならず、「電場又は磁場、疎水性／親水性の領域、流体および気体間の界面、および／または、粘性の異なるレベルの液体間の界面」によっても形成されるものであって、後者によって形成される有効領域には、空間的に塞がれているものとは認められないものを明らかに包含している。そうすると、空間的に塞がれたキャビティが形成されること（閉鎖系アレイ）を特徴とするという上記主張２は、そもそも本願発明１の発明特定事項に基づいた主張ではなく、当該主張が本願発明１全体の優位性を示すものとは認められない。 さらにいえば、空間的に塞がれたキャビティが形成されること（閉鎖系アレイ）について、相違点２について判断したとおり、引用発明においても母体となる基板上に配置された各セル間にセル分離用の隔壁を設けていることから、母体となる基板と転写基板が結合した状態で複数のＤＮＡをＰＣＲ法により増幅すれば、母体となる基板、セル分離用の隔壁及び転写基板で囲まれた、塞がれた（閉鎖系の）空間が形成されることは明らかである。 よって、上記主張２も採用できない。 第７　結び 以上のとおりであるから、本願請求項１に係る発明は、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができないものであり、他の請求項に係る発明について論及するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。 よって、結論のとおり審決する。