2023-020329

特願２０２０－５１６５２５「標的化核酸編集のための系、方法、及び組成物」拒絶査定不服審判事件〔平成３１年 ３月２８日国際公開、ＷＯ２０１９／０６０７４６、令和 ２年１２月１０日国内公表、特表２０２０－５３５８０２〕について、次のとおり審決する。

結 論 本件審判の請求は、成り立たない。

理 由 第１ 手続の経緯 本願は、平成３０年９月２１日（パリ条約による優先権主張 ２０１７年９月２１日 （ＵＳ）アメリカ合衆国）を国際出願日とする出願であって、その主な手続の経緯は以下のとおりである。 令和 ４年１０月１８日付け 拒絶理由通知書 令和 ５年 ４月１８日 意見書、手続補正書の提出 令和 ５年 ７月２７日付け 拒絶査定 令和 ５年１１月３０日 審判請求書、手続補正書の提出 第２ 令和５年１１月３０日にされた手続補正についての補正の却下の決定 ［補正の却下の決定の結論］ 令和５年１１月３０日にされた手続補正（以下、「本件補正」という。）を却下する。 ［理由］ １ 補正の内容 本件補正により、特許請求の範囲の請求項１の記載は、 「【請求項１】 触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、前記ｄＣａｓ１３が、前記Ｃ末端上の少なくとも２０、少なくとも４０、少なくとも６０、少なくとも８０、少なくとも１００、少なくとも１２０、少なくとも１４０、少なくとも１６０、少なくとも１８０、少なくとも２００、少なくとも２２０、少なくとも２４０、少なくとも２６０、または少なくとも３００アミノ酸短縮されるか、および／または、前記ｄＣａｓ１３が、前記Ｎ末端上の少なくとも２０、少なくとも４０、少なくとも６０、少なくとも８０、少なくとも１００、少なくとも１２０、少なくとも１４０、少なくとも１６０、少なくとも１８０、少なくとも２００、少なくとも２２０、少なくとも２４０、少なくとも２６０、または少なくとも３００アミノ酸短縮される、系。」 から、 「【請求項１】 触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、 ｄＣａｓ１３がＣ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、またはＣ末端Δ９３４－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または ｄＣａｓ１３がＮ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する、系。」（以下、「本件補正発明」という。） に補正された。（下線部は補正箇所である。） ２ 補正の適否 本件補正は、触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）の短縮について、 「ｄＣａｓ１３が、前記Ｃ末端上の少なくとも２０、少なくとも４０、少なくとも６０、少なくとも８０、少なくとも１００、少なくとも１２０、少なくとも１４０、少なくとも１６０、少なくとも１８０、少なくとも２００、少なくとも２２０、少なくとも２４０、少なくとも２６０、または少なくとも３００アミノ酸短縮されるか、および／または、前記ｄＣａｓ１３が、前記Ｎ末端上の少なくとも２０、少なくとも４０、少なくとも６０、少なくとも８０、少なくとも１００、少なくとも１２０、少なくとも１４０、少なくとも１６０、少なくとも１８０、少なくとも２００、少なくとも２２０、少なくとも２４０、少なくとも２６０、または少なくとも３００アミノ酸短縮される」 を 「ｄＣａｓ１３がＣ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、またはＣ末端Δ９３４－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または ｄＣａｓ１３がＮ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する」 と限定するものであるから、特許法第１７条の２第５項第２号の特許請求の範囲の減縮を目的とするものに該当する。 そこで、本件補正発明が特許出願の際独立して特許を受けることができるものであるかどうか（特許法第１７条の２第６項において準用する同法第１２６条第７項の規定に適合するかどうか）について以下に検討する。 （１） 本件補正発明の優先日について ア 優先権基礎出願の出願書類に記載された事項 優先権基礎出願（米国特許仮出願第６２／５６１，６６９号）の出願書類には、次の事項が記載されている。 なお、英文で記載されているため、当審合議体による翻訳文にて記載した。また、原文にない下線は、強調のために当審合議体が付したものである。以下、同様である。 （ア） 特許請求の範囲 「１． ａ）ターゲティング成分または前記ターゲティング成分をコードするヌクレオチド配列、およびｂ）塩基編集成分または前記塩基編集成分をコードするヌクレオチド配列を含む、標的遺伝子座で核酸を改変するのに好適なエンジニアリングされた天然に存在しない系。 ２． 前記ターゲティングドメインが、ＤＮＡ結合タンパク質もしくはその機能性部分、またはＲＮＡ結合タンパク質もしくはその機能性部分である、請求項１に記載の系。 ・・・ ４． 前記ＲＮＡ結合タンパク質が、Ｃａｓ１３タンパク質であり、前記系が、ガイド配列を含むガイド分子、または前記ガイド分子をコードするヌクレオチド配列をさらに含む、請求項２に記載の系。 ５． 前記Ｃａｓ９、Ｃｐｆ１、またはＣａｓ１３が、失活Ｃａｓ９、失活Ｃｐｆ１、または失活Ｃａｓ１３である、請求項３または４に記載の系。」 （イ） 第４２０－４５８頁（実施例３） 「実施例３ ［０８３０］ （略） ［０８３４］ここで、哺乳類細胞におけるＲＮＡノックダウン活性のためのＣａｓ１３酵素の全てのファミリーを評価し、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５由来のＣａｓ１３ｂオルソログ（ＰｓｐＣａｓ１３ｂ）を、哺乳類細胞適用に最も効率的かつ特異的なものとして同定する。次いで、ＡＤＡＲ２デアミナーゼドメイン（ＡＤＡＲＤＤ）を触媒的に不活性なＰｓｐＣａｓ１３ｂに融合して、レポーターおよび内因性転写物、ならびに疾患関連突然変異のプログラム可能なＡ→Ｉ（Ｇ）置換（ＲＥＰＡＩＲ）のＲＮＡ編集を実証する。最後に、ｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲ２ＤＤ融合物の特異性を改善して、特異性が１７０倍超増加したＲＥＰＡＩＲｖ２を生成するための合理的な突然変異誘発スキームを採用する。 （略） Ｃａｓ１３－ＡＤＡＲ融合物は、標的化ＲＮＡ編集を可能にする ［０８６７］ＰｓｐＣａｓ１３ｂが、哺乳類細胞におけるｍＲＮＡの一貫して、ロバストかつ特異的なノックダウンを達成したことを考えると、それは、プログラム可能なＲＮＡ編集のためにＡＤＡＲ（ＡＤＡＲＤＤ）のデアミナーゼドメインを動員するＲＮＡ結合プラットフォームとして適応することができたと想定された。ヌクレアーゼ活性が欠如しているＰｓｐＣａｓ１３ｂ（ｄＰｓｐＣａｓ１３ｂ、ここからはｄＣａｓ１３ｂと呼ぶ）をエンジニアリングするため、ＨＥＰＮドメインにおいて保存触媒残基を変異させて、ルシフェラーゼＲＮＡノックダウン活性の損失が観察された（図５７Ａ）。ｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲＤＤ融合物が、ガイドＲＮＡによって標的アデノシンに動員することができ、ハイブリダイズしたＲＮＡが、ＡＤＡＲ活性のための必須の二本鎖基質を生成することができることを仮定した（図５０Ａ）。標的アデノシン脱アミノ化率を強化するため、初期のＲＮＡ編集設計に２つの追加の改変を導入した：標的アデノシンの反対側のミスマッチシチジン（これは脱アミノ化頻度を増加させることが以前に報告されている）を導入し、Ｃａｓ１３ｂを、過剰活性化した突然変異を含むヒトＡＤＡＲ１またはＡＤＡＲ２のデアミナーゼドメインと融合し、触媒活性（ＡＤＡＲ１ＤＤ（Ｅ１００８Ｑ）（２５）またはＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）（１９））を強化した。 （略） ［０８７３］ＲＥＰＡＩＲｖ１系を疾患細胞に送達することは、治療的使用の前提条件であるため、従って、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターなどの治療上適切なウイルスベクターにパッケージングすることができるＲＥＰＡＩＲｖ１構築物を設計しようとした。ＡＡＶベクターは、４．７ｋｂのパッケージング制限を有し、プロモーターおよび発現調節エレメントと共に、大きいサイズのｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲＤＤ（４４７３ｂｐ）を収容することができない。サイズを低下させるため、ＲＮＡ編集活性のためのＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）に融合したｄＣａｓ１３の様々なＮ末端およびＣ末端短縮を試験した。試験した全てのＣ末端短縮は、まだ機能しており、かつ、ルシフェラーゼシグナルを回復することができることが判明し（図５９）、最大の短縮であるＣ末端Δ９８４－１０９０（融合タンパク質の合計サイズは４，１５２ｂｐ）は、ＡＡＶベクターのパッケージング制限内に収まるほど十分に小型であった。 （略）」 （ウ） ［００５４］、図４８ ［００５４］ 図４８ Ｃａｓ１３ｂ １２のＣ末端短縮は、ＡＤＡＲ編集において依然として活性が高い。 ［図：0001438625000001.jpg］ （エ） ［００６５］、図５９ ［００６５］ 図５９ ｄＣａｓ１３ｂの短縮は、機能性ＲＮＡ編集を依然として有する。ｄＣａｓ１３ｂの様々なＮ末端およびＣ末端短縮により、ルシフェラーゼシグナルの回復によって測定されるように、ＲＮＡ編集が可能になる。 ［図：0001438625000002.jpg］ イ 優先権主張の検討 優先基礎出願の出願書類の図５９には、ｄＣａｓ１３ｂの様々なＮ末端およびＣ末端短縮が記載されており（上記ア（エ））、前記ｄＣａｓ１３ｂはヌクレアーゼ活性が欠如しているＰｓｐＣａｓ１３ｂ（ｄＰｓｐＣａｓ１３ｂ）であり（上記ア（イ）［０８６７］）、前記ＰｓｐＣａｓ１３ｂはＰｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５由来のＣａｓ１３ｂオルソログである（上記ア（イ）［０８３４］）。図４８には、Ｃａｓ１３ｂ １２の様々なＮ末端およびＣ末端短縮が記載されている（上記ア（ウ））。前記Ｃａｓ１３ｂ １２がいかなるものであるのかが明記されていないが、本願の発明の詳細な説明には、Ｃａｓ１３ｂ １２（ＰｓｐＣａｓ１３ｂ）と記載されている（【０９４９】段落）。そして、本願の発明の詳細な説明で用いられる文言と、本願の優先基礎出願の出願書類中で用いられる文言は同じことを意味すると通常いえるから、優先権基礎出願の出願書類には、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するアミノ酸位置で表して、Ｃ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、Ｃ末端Δ９８４－１０９０、Ｎ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されているｄＣａｓ１３ｂが記載されている（上記ア（イ）－（エ））。前記ｄＣＡＳ１３ｂは、請求項５における失活Ｃａｓ１３に該当するから（上記ア（ア））、優先権基礎出願の出願書類には、 「触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、 ｄＣａｓ１３がＣ末端Δ１０２６－１０９０、またはＣ末端Δ１０５３－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または ｄＣａｓ１３がＮ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する、系。」 が記載されているものの、ｄＣａｓ１３がＣ末端Δ９３４－１０９０で短縮されている系は記載されておらず、記載されているに等しいといえる事情も見出せない。 したがって、本件補正発明のうち、 「触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、 ｄＣａｓ１３がＣ末端Δ９３４－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する、系。」（以下、「本件補正発明Δ９３４－１０９０」という。） については、優先権主張の利益を享受することができない。 ウ 審判請求人の主張について 審判請求人は、審判請求書において、本件補正発明は、優先権基礎出願の出願書類（図４８および図５９、および実施例３）に記載されており、優先権主張の利益を享受することができると主張している。しかし、図４８および図５９には、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するアミノ酸位置で表して、Ｃ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、Ｃ末端Δ９８４－１０９０、Ｎ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されているｄＣａｓ１３ｂが記載されているものの（上記ア（イ）－（エ））、Ｃ末端Δ９３４－１０９０で短縮されているｄＣａｓ１３ｂは記載されていない。図４８および図５９の文字は不鮮明であるが、図５９について述べている「最大の短縮であるＣ末端Δ９８４－１０９０（融合タンパク質の合計サイズは４，１５２ｂｐ）」との記載を参照すれば（上記ア（イ）［０８７３］）、Δ９３４－１０９０ではなくΔ９８４－１０９０が記載されていることは明らかである。そして、実施例３には、上記ア（イ）［０８７３］以外に、ｄＣａｓ１３ｂの短縮に関する記載はない。そうすると、本件補正発明Δ９３４－１０９０については、審判請求人の主張は採用できない。 エ 小括 以上のとおり、本件補正発明Δ９３４－１０９０は、優先権主張の利益を享受することができないから、特許法第２９条に規定される要件の判断の基準日は、現実の国際出願日である平成３０年（２０１８年）９月２１日である。 （２） 引用例２の記載事項 原査定の拒絶の理由で引用された、本願の国際出願日前に日本国内又は外国において頒布された刊行物であって、本件補正発明Δ９３４－１０９０に対する先行技術文献であるＳｃｉｅｎｃｅ，２０１７年１１月２４日，Ｖｏｌ．３５８，ｐｐ．１０１９－１０２７（以下、「引用例２」という。）には、次の事項が記載されている。 ア 「ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ１３によるＲＮＡ編集」 （表題） イ 「核酸編集は、遺伝病を治療する上で大きな可能性を有しており、特にＲＮＡレベルでは、疾患に関連する配列を修復して機能的なタンパク質産物を得ることができる。ＶＩ型ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓシステムは、プログラム可能な単一エフェクターであるＲＮＡガイド型リボヌクレアーゼ Ｃａｓ１３を含んでいる。我々は、強力なノックダウンを可能とする Ｃａｓ１３オルソログを工学的に構築するためにＶＩ型システムをプロファイリングし、触媒活性を失わせたＣａｓ１３（ｄＣａｓ１３）を用いて、ＡＤＡＲ２（ＲＮＡを基質とするアデノシンデアミナーゼ２型）のアデノシンからイノシンへの脱アミノ化活性を哺乳類細胞内の転写産物へ誘導することにより、ＲＮＡ編集を実証した。このシステムは、プログラム可能なＡ→Ｉ置換のためのＲＮＡ編集（ＲＥＰＡＩＲ）と呼ばれ、厳密な配列制約を持たず、病原性変異を含む全長転写産物を編集するために使用できる。さらに我々は、このシステムを工学的に改変して高特異性の変異体を作製し、ウイルス送達を容易にするためにシステムを小型化した。ＲＥＰＡＩＲは、研究、治療、そしてバイオテクノロジーに広く応用可能な、有望なＲＮＡ編集プラットフォームを提示するものである。」（要旨） ウ 「Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５由来のＣａｓ１３ｂ（ＰｓｐＣａｓ１３ｂ）」（ｐ．１０２０右欄第２９行） エ 「ヌクレアーゼ活性が欠如しているＰｓｐＣａｓ１３ｂ（ｄＰｓｐＣａｓ１３ｂ、ここからはｄＣａｓ１３ｂと呼ぶ）をエンジニアリングするため、ＨＥＰＮドメインにおいて保存触媒残基を変異させて、ルシフェラーゼＲＮＡノックダウン活性の損失が観察された（図Ｓ４Ａ）。ｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲＤＤ融合物が、ガイドＲＮＡによって標的アデノシンに動員され、ハイブリダイズしたＲＮＡが、ＡＤＡＲ活性のための必須の二本鎖基質を生成することができることを仮定した（図２Ａ）。」（ｐ．１０２１右欄第３～１１行） オ 「この活性の実証から、ｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）をさらなる特徴付けのために選択して、このシステムをプログラム可能なＡ→Ｉ置換のためのＲＮＡ編集バージョン１（ＲＥＰＡＩＲｖ１）と命名した。」（ｐ．１０２２右欄第１８－２２行） カ 「ＲＥＰＡＩＲｖ１系を疾患細胞に送達することは、治療的使用の前提条件であるため、従って、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）ベクターなどの治療上適切なウイルスベクターにパッケージングすることができるＲＥＰＡＩＲｖ１構築物を設計しようとした。ＡＡＶベクターは、４．７ｋｂのパッケージング制限を有し、プロモーターおよび発現調節エレメントと共に、大きいサイズのｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲＤＤ（４４７３ｂｐ）を収容することができない。サイズを低下させるため、ＲＮＡ編集活性のためのＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）に融合したｄＣａｓ１３の様々なＮ末端およびＣ末端短縮を試験した。試験した全てのＣ末端短縮は、まだ機能しており、かつ、ルシフェラーゼシグナルを回復することができることが判明し（図Ｓ７）、最大の短縮であるＣ末端Δ９８４－１０９０（融合タンパク質の合計サイズは４，１５２ｂｐ）は、ＡＡＶベクターのパッケージング制限内に収まるほど十分に小型であった。」（ｐ．１０２２右欄 下から１３行－ｐ．１０２３左欄第５行） キ （図Ｓ７） ［図：0001438625000003.jpg］ 図Ｓ７：ｄＣａｓ１３ｂの短縮は、機能性ＲＮＡ編集を支持する。 （３） 引用発明 引用例２の図Ｓ７には、ｄＣａｓ１３ｂの様々なＮ末端およびＣ末端短縮が記載されており（上記（２）キ）、前記ｄＣａｓ１３ｂはヌクレアーゼ活性が欠如しているＰｓｐＣａｓ１３ｂ（ｄＰｓｐＣａｓ１３ｂ）であり（上記（２）エ）、前記ＰｓｐＣａｓ１３ｂはＰｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５由来のＣａｓ１３ｂである（上記（２）ウ）。さらに、引用例２に記載の、ＲＥＰＡＩＲｖ１系を疾患細胞に送達するためのＲＥＰＡＩＲｖ１構築物とはｄＣａｓ１３ｂをコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドであり（上記（２）カ）、ルシフェラーゼシグナルを回復させた試験ではＲＥＰＡＩＲｖ１構築物がコードするｄＣａｓ１３ｂがタンパク質として発現されていると認められ（上記（２）カ）、図Ｓ７には、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するアミノ酸位置で表して、Ｃ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、Ｃ末端Δ９８４－１０９０、Ｎ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されているｄＣａｓ１３ｂが記載されている（上記（２）ウ－キ）。ここでＲＥＰＡＩＲｖ１系とは、ＲＥＰＡＩＲｖ１構築物から発現されたタンパク質ｄＣａｓ１３ｂを含むものであることが文脈上明らかだから、引用例２には次の発明（以下、「引用発明」という。）が記載されていると認められる。 「触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）を含むＲＥＰＡＩＲｖ１系、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含むＲＥＰＡＩＲｖ１構築物であって、 ｄＣａｓ１３がＣ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、またはＣ末端Δ９８４－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または ｄＣａｓ１３がＮ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する、系または構築物。」 （４） 対比 本件補正発明Δ９３４－１０９０と引用発明とを対比する。引用発明における「ＲＥＰＡＩＲｖ１系」は、「ＲＥＰＡＩＲｖ１構築物」から発現されるものであって、ｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）を含み、ｄＣａｓ１３ｂ－ＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）とは人工的なアミノ酸変異を含むｄＣａｓ１３ｂとＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）の融合タンパク質である（上記（２）エ、オ）。そうすると、「ＲＥＰＡＩＲｖ１系」および「ＲＥＰＡＩＲｖ１構築物」は、いずれも、本件補正発明Δ９３４－１０９０における「エンジニアリングされた天然に存在しない系」に該当する。 よって、両者は、 「触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、 ｄＣａｓ１３がＣ末端で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する」である点で一致し、 前記短縮が、本件補正発明Δ９３４－１０９０においてはＣ末端Δ９３４－１０９０であるのに対し、引用発明においてはＣ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、Ｃ末端Δ９８４－１０９０、Ｎ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２である点（以下、「相違点」という。）で相違する。 （５） 判断 引用例２には、ｄＣａｓ１３ｂの全長をコードするポリヌクレオチドを、ＲＮＡ編集活性のためのＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）をコードするポリヌクレオチドに融合し（４４７３ｂｐ）、さらにプロモーターおよび発現調節エレメントと組み合わせると、ＡＡＶベクターにパッケージングできる上限である４．７ｋｂを超えてしまうことから、ｄＣａｓ１３の様々なＮ末端およびＣ末端短縮を試験したこと、および試験したＣ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０およびＣ末端Δ９８４－１０９０（融合タンパク質の合計サイズは４，１５２ｂｐ）は、いずれも、ＲＮＡ編集活性を維持し、かつＡＡＶベクターのパッケージング制限内におさまることが記載されている（上記（２）イ、カ、キ）。 ここで、引用発明のＲＥＰＡＩＲｖ１は、研究や治療をはじめとしたバイオテクノロジーに広く応用することを予定しているＲＥＰＡＩＲの有用性を実証するためのバージョン１という１つの具体例なのだから（上記（２）イ、オ）、ＲＥＰＡＩＲｖ１構築物をＡＡＶベクターへのパッケージングに最適な塩基長に近づけるため、ＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）よりも大きいポリペプチドと組み合わせるため、または異なるエレメントを追加するため等の目的で、さらなる短縮型を網羅的に作製して試験を行い、その過程で、多くの短縮型の一つとしてＣ末端Δ９３４－１０９０で短縮されたｄＣＡＳ１３ｂを得ることは、周知技術を用いて当業者が容易になし得る事項である。 次に、本件補正発明Δ９３４－１０９０の奏する効果について検討する。本願の発明の詳細な説明には、Ｎ末端およびＣ末端の各々から２０アミノ酸を徐々に短縮したＣａｓ１３ｂ１２（ＰｓｐＣａｓ１３ｂ）をＡＤＡＲ２ＤＤ（Ｅ４８８Ｑ）に融合し、ＲＮＡ編集活性を評価した結果が示されており（【０９４９】段落、図６９）、タンパク質長が９９０、９７０、９５０、および９３０となる短縮型は、同程度のＲＮＡ編集活性を有することが見てとれる（図６９ Ｃ末端の図の右から６－９個めの結果）。そして、本件補正発明Δ９３４－１０９０は概ね９３０となる短縮型に相当するところ、引用発明のＣ末端Δ９８４－１０９０は概ね９９０となる短縮型に相当することを考慮すると、Ｃ末端Δ９３４－１０９０で短縮することにより生じるタンパク質長９３３の短縮型が、引用発明と比べて当業者の予測し得ない顕著な効果を奏すると認めることはできない。 このとおり、本件補正発明Δ９３４－１０９０は、引用例２記載の発明に基づいて当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により、特許出願の際独立して特許を受けることができないものである。 （６） むすび 以上のとおりであるから、本件補正は、特許法第１７条の２第６項において準用する同法第１２６条第７項の規定に違反するものであり、同法第１５９条第１項の規定において読み替えて準用する同法第５３条第１項の規定により却下されるべきものである。 第３ 本願発明について １． 本願発明 令和５年１１月３０日にされた手続補正は上記のとおり却下されたので、本願の請求項１～２６に係る発明は、令和５年４月１８日に提出された手続補正書の特許請求の範囲の請求項１～２６に記載された事項により特定されるものであるところ、そのうち、請求項１および２に係る発明は、次のとおりのものである。 「【請求項１】 触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、前記ｄＣａｓ１３が、前記Ｃ末端上の少なくとも２０、少なくとも４０、少なくとも６０、少なくとも８０、少なくとも１００、少なくとも１２０、少なくとも１４０、少なくとも１６０、少なくとも１８０、少なくとも２００、少なくとも２２０、少なくとも２４０、少なくとも２６０、または少なくとも３００アミノ酸短縮されるか、および／または、前記ｄＣａｓ１３が、前記Ｎ末端上の少なくとも２０、少なくとも４０、少なくとも６０、少なくとも８０、少なくとも１００、少なくとも１２０、少なくとも１４０、少なくとも１６０、少なくとも１８０、少なくとも２００、少なくとも２２０、少なくとも２４０、少なくとも２６０、または少なくとも３００アミノ酸短縮される、系。 【請求項２】 前記Ｃａｓ１３エフェクタータンパク質の短縮型が、Ｃ末端Δ１０２６－１０９０、Ｃ末端Δ１０５３－１０９０、Ｃ末端Δ９３４－１０９０、Ｃ末端Δ８８４－１０９０、Ｃ末端Δ８３４－１０９０、Ｃ末端Δ７８４－１０９０、またはＣ末端Δ７３４－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または 前記Ｃａｓ１３エフェクタータンパク質の短縮型が、Ｃ末端Δ７９５－１０９５で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｒｉｅｍｅｒｅｌｌａ ａｎａｔｉｐｅｓｔｉｆｅｒ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または、 前記Ｃａｓ１３エフェクタータンパク質の短縮型が、Ｃ末端Δ８７５－１１７５、Ｃ末端Δ８９５－１１７５、Ｃ末端Δ９１５－１１７５、Ｃ末端Δ９３５－１１７５、Ｃ末端Δ９５５－１１７５、Ｃ末端Δ９７５－１１７５、Ｃ末端Δ９９５－１１７５、Ｃ末端Δ１０１５－１１７５、Ｃ末端Δ１０３５－１１７５、Ｃ末端Δ１０５５－１１７５、Ｃ末端Δ１０７５－１１７５、Ｃ末端Δ１０９５－１１７５、Ｃ末端Δ１１１５－１１７５、Ｃ末端Δ１１３５－１１７５、Ｃ末端Δ１１５５－１１７５で短縮されており、アミノ酸位置が、Ｐｏｒｐｈｙｒｏｍｏｎａｓ ｇｕｌａｅ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応するか、または 前記Ｃａｓ１３エフェクタータンパク質の短縮型が、Ｎ末端Δ１－１２５、Ｎ末端Δ１－８８、またはＮ末端Δ１－７２で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する、 請求項１に記載の系。」 そこで、請求項２に係る発明について検討する。請求項２に係る発明は、Ｃａｓ１３エフェクタータンパク質の短縮型として複数の選択肢を有しており、そのうち、「Ｃ末端Δ９３４－１０９０」「で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する」ものを選択した発明は、 「触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質（ｄＣａｓ１３）、または前記触媒的に不活性なＣａｓ１３エフェクタータンパク質をコードするヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを含む、エンジニアリングされた天然に存在しない系であって、前記ｄＣａｓ１３が、Ｃ末端Δ９３４－１０９０で短縮されており、前記短縮のアミノ酸位置が、Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｓｐ．Ｐ５－１２５ Ｃａｓ１３ｂタンパク質のアミノ酸位置に対応する、系。」（以下、「本願発明２Δ９３４－１０９０」という。） である。 ２． 原査定の拒絶の理由 原査定の拒絶の理由は、以下のものを含む。 本願の請求項１－１０、１３、１９－２４に係る発明は、本願の国際出願日前に日本国内又は外国において頒布された刊行物であるＳｃｉｅｎｃｅ，２０１７年１１月２４日，Ｖｏｌ．３５８，ｐｐ．１０１９－１０２７（上記第２の２（２）の「引用例２」である。）に記載された発明であるから、特許法第２９条第１項第３号に該当し、特許を受けることができない。また、本願の請求項１－１０、１３、１９－２４に係る発明は、引用例２に記載された発明に基づいて、当業者が容易に発明をすることができたものであるから、特許法第２９条第２項の規定により特許を受けることができない。 ３． 引用例およびその記載事項 原査定の上記拒絶の理由に引用された引用例２の記載事項は、上記第２の２（２）に記載したとおりである。 ４． 対比 本願発明２Δ９３４－１０９０は、本件補正発明Δ９３４－１０９０と同一であるから、引用発明と対比すると、上記相違点の他に、新たな相違点を有さない。 そうすると、本願発明２Δ９３４－１０９０は、本件補正発明Δ９３４－１０９０について述べた上記第２の２（５）と同様の理由により、引用例２の記載に基いて、当業者が容易に発明をすることができたものである。 第４ むすび 以上のとおり、本願発明２Δ９３４－１０９０は、原査定の上記拒絶の理由で示されたとおり、特許法第２９条第２項の規定により、特許を受けることができないものであるから、その余について検討するまでもなく、本願は拒絶すべきものである。 よって、結論のとおり審決する。